Après avoir porté secours à leur ami Kida et ainsi révélé leurs jeux cachés, Mikado et Anri durent supporter le départ surprise de leur ami avec Saki, une fille qu'il aimait et qui s'était fait kidnappée par le Carré Bleu, un gang malfaisant qui se battait à l'époque contre les Écharpes Jaunes. Elle se fit briser les deux jambes par leur chef. C’est après avoir avoué la vérité à la jeune fille que Kida se remit avec elle et fugua avec toutefois de la douleur, n’ayant pas envie de quitter ses meilleurs amis. Mikado rassura Anri en lui disant qu’il allait surement revenir, et que ce n’était qu’une question de temps.

Izaya s’était à présent fait recalé par Saki, il prévoit de partir et de rentrer dans la clandestinité. Mais rien n’est sûr et personne ne sait se qu’il manigance à présent, étant donné qu’il possède toujours la tête de Celty et quelques autres objets louches. Shizuo lui continu encore et toujours de le chasser et de lui courir après pour essayer de se venger de toutes ses années de souffrances. Ses habitudes ne changent pas et il continu toujours à travailler en tant que Barman.

Le quarto de Kyohei, Saburo, Erika et Walker eux non plus ne changent pas, et continuent leur petite vie « paisible » à s’occuper ici et là ensembles. Seiji et Mika sont toujours collés l’un à l’autres, eux aussi, ne se lâchant pas. Celty et Shinra, quant à eux, vivent en grande harmonie ensembles. La Dullahan ayant abandonné les recherches à propos de sa tête, elle vie à présent dans le bonheur et dans l’amour. Shinra a réussis quant à lui à chasser son père qui ne présageait rien de bons en partant.

Malgré les apparences, les gangs ne se sont pas tous estompés. Ils restent encore des rebelles aux cœurs de pierre et à l’envie de vengeance et de meurtre, qui dans le noir, regroupent de plus en plus de personnes… Sans compter la reconstitution secrète des Carrés Bleus. Lentement, sûrement, sournoisement, tout se construit à l’insu des habitants vivant dans leur quotidien habituel. Même si tout cela ne paraît pas à de bons augures, ...

« BIENVENUE A IKEBUKURO ! »